请教关于TCGA数据的问题
2个回答
2017-11-13
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Case列显示的是该文件里数据来自于多少cases。比如569,说明这个文件整合了所有569个cases的genotyping数据,有些数字为1的,说明这个文件里只有一个case的数据。
对于RNAseq后续的分析,如果要用软件比如limma,edgeR比较表达差异的基因,就用counts数据。如果你想自己做t-test,下载counts数据自己做normalization再进行比较也行,或者下载已经做过normalization的RPKM/RPKM-UQ直接比较也行
癌旁的数据也包含在这些cases里了,下载metadata就能看到每个sample的信息,你会发现有些是来自solid tissue normal,这些都是癌旁的数据
对于RNAseq后续的分析,如果要用软件比如limma,edgeR比较表达差异的基因,就用counts数据。如果你想自己做t-test,下载counts数据自己做normalization再进行比较也行,或者下载已经做过normalization的RPKM/RPKM-UQ直接比较也行
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威孚半导体技术
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三气周瑜,大战马超周瑜乘势到南郡,与曹仁交战,中曹操之计而重伤。诸葛亮坐收渔利,夺下南郡。不久又陆续攻占荆襄诸郡。刘备终于有了自己的土地。周瑜又定下美人计,诱刘备过江,与孙权之妹孙尚香成亲,以此为饵扣押刘备。赵云受诸葛亮密技,一次次粉碎周瑜的计谋。次年刘备逃回荆州,周瑜追至,中诸葛亮之计,更为荆州士兵取笑,箭创复发。回柴桑后定下假途灭虢之计取荆州,再次为诸葛亮识破。回柴桑后性命垂危,高叹“既生瑜,何生亮”而亡。诸葛亮又去吊孝,打破两方之间的尴尬,并为刘备寻得副军师庞统。[1]
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