原核生物基因转录起始的正确性取决于
原核生物基因转录起始的正确性取决于RNA聚合酶σ因子。
σ因子是一种非专一性蛋白,作为所有RNA聚合酶的辅助因子起作用。σ因子是DNA依赖的RNA聚合酶的固有组分,它识别启动子共有序列且与RNA聚合酶结合转变为聚合酶全酶。σ因子本身并不能与 DNA结合,但是与核心酶的相互作用会激活它的DNA结合区段。
通过磷酸纤维素化,σ因子可从酶上解离,因而σ因子很易分离获得。在以噬菌体DNA等没受损伤的双链DNA为模板时,缺少σ因子的核心酶几乎都没有RNA合成活性,若添加σ因子,就会显著促进RNA的合成。
这种促进效果和RNA聚合酶与DNA的结合以及在RNA合成开始阶段的作用,含σ因子的全酶与DNA上被限定的特定部位(启动子)牢固地结合,使RNA的合成能从正确的部位开始进行。反应开始的酶一旦游离出σ因子,核心酶就进行RNA链延长反应,游离的σ因子在下次开始反应时,再被利用。
目前尚不了解,这种替代如何调控的,现在认为机制可能很复杂,牵涉到其他好几种蛋白质。这种替代并不完全,而且被替代下的的σ43也未完全被灭活。大约还有10%的核心酶仍和σ43相结合,所以可能还有某些营养型酶在芽孢形成时仍存在于细胞中。
σ因子的作用:
1、σ因子的作用是负责模版链的选择和转录的起始,它是酶的别构效应物,使酶专一性识别模版上的启动子。
2、σ因子可以极大的提高RNA聚合酶对启动子区DNA序列的亲和力。
3、σ因子还能使RNA聚合酶与模版DNA上非特异性位点结合常数降低。