《特殊使命》不仅具有人物的双重身份线索,而且还采取了套中套的情节设计,一方面让电视观众逐渐从限制性视点进入全知视点,为剧中人物的误解和被误解而心急如焚;另一方面,又潜伏了一些未知信息,来推动故事情节发展的曲折离奇,如剧中的国民党女特务欧阳荷最后才暴露其地下党身份,产生了意料之外情理之中的效果(人民日报评) 。
《特殊使命》以众多特殊之处牢牢抓住观众的眼球。形式之特殊,用谍战戏包装,但更着力写人物的命运,这种人文主题,高于以往的国产谍战片套路。剧情之特殊,开篇便设置悬疑,让观众跟随着剧中的线索进行推理、猜测(辽沈晚报评) 。