shell脚本基本命令
首先打开编程界面，查看现在dog目录下的文件的权限信息。现在b.txt的用户权限是RW，组权限是RW，其他权限是R。现在我给用户权限加上X运行权限。
新建一个文件shell脚本一般用×.sh作为后缀当然勇气他的也可以。打开终端输入touchfirst.sh新建一个名为first的shell脚本。
在shell脚本中可以使用三类命令：1)Unix命令：虽然在shell脚本中可以使用任意的unix命令，但是还是由一些相对更常用的命令。这些命令通常是用来进行文件和文字操作的。
在UNIX/Linux下面编写一个SHELL脚本程序并不难，只要全屏幕编辑程序vi使用得熟练，即可以编写SHELL脚本程序。
符号显示上一条命令的返回值，如果为0则代表执行成功，其他表示失败。
用特殊变量：$？判断前一个命令的执行是否成功（或者说是返回码）执行成功变量的值是0，不是零表示没有执行成功例如：注意：一定要在命令执行后立即判断，否则后面的代码会冲掉$？变量的值。
shell脚本中判断上一个命令是否执行成功shell中使用符号“$？”来显示上一条命令执行的返回值，如果为0则代表执行成功，其他表示失败。结合if-else语句实现判断上一个命令是否执行成功。
第一步，将编写的bat批处理文件拖到cmd命令窗口中，以定期清除旧数据，见下图，转到下面的步骤。
、可以通过ps命令获取所有的进程，然后通过awk命令提取进程名，再用grep提取相应的进程名即可。
1、第一种：BourneshellBourneshell又包括Bourneshell(sh)、Kornshell(ksh)、BourneAgainShell(bash)三种类型。Bourneshell(sh)由AT&T的SteveBourne开发，是标准的UNIXShell，很多UNIX系统都配有sh。
2、开头程序必须以下面的行开始（必须方在文件的第一行）：！/bin/sh符号#！用来告诉系统它后面的参数是用来执行该文件的程序。在这个例子中我们使用/bin/sh来执行程序。
3、沿着前面的轨迹，接下来是Linux中shell脚本的学习。这对于生信工程师后续处理大量(海量更合适些)数据是非常非常重要的，但是同样的，作为一个有点古板的人，对于脚本是什么意思我都死磕了好久。
4、先看《鸟哥的Linux私房菜-基础学习篇》，这个建议买本书，随时可翻。
）while外层的read依次读取的是文件pbook中的每一行，而内层的read是从console读取的内容。2）要实现whileread的嵌套，可以使用exec命令，将I/O重定向。注意exec的用法，以及括号的使用。
在shell脚本中，用来读取文件内各个域的内容并将其赋值给Shell变量的命令是：read-pinputaval：valecho$val。read-从标准输入读取数值。这个read内部命令被用来从标准输入读取单行数据。
while条件do...done应该前面还有个do的。这是固定结构，满足条件就会一直循环下去。因为最后有输入重定向符号，将整个while循环条件的输入指定为config变量定义的文件。
