Question

请问我从NCBI里面查出来的基因序列是模板链还是编码链的序列？

我在NCBI搜索到了编码一种蛋白的基因序列，请问查出来的基因序列是转录相应mRNA的那条链（模板链）还是另一条互补的链（编码链）的序列？

Answer 1

是编码链。用错链对引物设计有影响，因为核苷酸结构不对称，分三端和五端。
所以5'-atcgxxxxxxxxxxxxxx
和
3‘-atcgxxxxxxxxxxxxxx是两个不同的引物分子。
引物设计软件都使用编码链，所以楼主不用烦了直接复制粘贴好了哇。

Answer 2

编码链。因为你从NCBI上可以用它的ORF搜索工具搜索DNA上的ORF的。软件识别的是DNA序列上的ATG和TAA\TAG\TGA的。因此它的DNA序列肯定是编码链的。