曲莱县境内横跨通天河(长江)和黄河。县城西北是宽谷大滩,地域辽阔,东南是山岭。全县平均海拔4500米以上,其中县城海拔4226米。该领土有山脉、盆地和海滩。主要山脉有昆仑山、巴颜喀拉、可可西里、东乌拉山。
曲莱县位于青海省西南部,玉树藏族自治州北部,三江源区,素有“河源第一县”之称。黄河发源于本县玛多乡岳古宗烈一带,长江北源主要源头马乐河、楚玛河、色吾河、代曲河均发源于本县,是我国南北两大水系的主要水源涵养区。地理位置为东经92° 56′~ 97° 35′,北纬33° 36′~ 35° 40′。陆地面积4.7万平方公里。