一、接口不同
1、IDE native：原生IDE模式，指的使用IDE接口。把“硬盘控制器”与“盘体”集成在一起的硬盘驱动器。
2、AHCI：高级主机控制器接口，由英特尔制定的技术标准。
二、优缺点不同
1、IDE native：价格低廉、兼容性强、性价比高，数据传输速度慢、线缆长度过短、连接设备少。
2、AHCI：在系统内存和串行ATA设备之间扮演一种接口的角色，而且它在不同的操作系统和硬件中是通用的。
三、特点不同
1、IDE native：IDE标准都能很好的向下兼容，例如ATA 133兼容ATA 66/100和Ultra DMA33，而ATA 100也兼容Ultra DMA 33/66。
2、AHCI：允许软件与SATA存储设备沟通的硬件机制，可让SATA存储设备激活高级SATA功能，例如原生指令队列及热插拔。
参考资料来源：百度百科- IDE接口
参考资料来源：百度百科-AHCI
IDE与AHCI区别如下：
IDE MODE 标准的IDE模式，兼容性较好；
AHCI（Serial ATA Advanced Host Controller Interface）MODE 串行ATA高级主控接口/高级主机控制器接口模式，允许存储驱动程序启用高级串行 ATA 功能，可以实现包括NCQ（Native Command Queuing）在内的诸多功能；
RAID MODE 是在 AHCI MODE 的基础上增加了磁盘的RAID 功能，可能实现磁盘的 RAID 0、RAID 1、RAID 5 等硬盘阵列功能，以提高磁盘的性能或提供硬盘的冗余保护功能；
RAID 模式是要有两块以上硬盘才能实现；较IDE模式使用AHCI模式好，性能能够提高约20%；
IDE兼容模式是为了保证XP的兼容性，如果使用Windows 7 系统，AHCI 模式是最佳选择，特别是对SSD硬盘！
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