应用数学(联合基础数学)是首批国家重点学科,基础数学和应用数学2001年再次被评为国家重点学科。数学系设有博士后流动站、数学一级学科博士点、首批国家理科人才培养基地和三个本科专业。数学是“九五”和“十五”“211”工程重点建设学科,也是浙江大学CAD&CG国家重点实验室的创办单位和主要依托单位。
2002年,国际著名数学家丘成桐教授在浙江大学创建数学科学研究中心并出任中心主任,一批在国内外有重要影响的数学家在浙江大学招收培养研究生,高水平的学术研究和交流对浙江大学数学学科的发展起到了重要的推动作用。