罗恩·保罗的后期国会生涯
在1996年保罗再次当选为共和党众议员。当时德州共和党党部的高层反对保罗参选，支持现任的Greg Laughlin，Laughlin原本是民主党籍，但在1994年共和党掌握国会后便加入了共和党。Laughlin不但获得共和党党部高层的青睐，还获得众议院议长纽特·金里奇（Newt Gingrich）以及当时担任德州州长的乔治·沃克·布什的背书，Laughlin并且批评保罗的政治观点是极端而古怪的。尽管如此，保罗最后仍以极大的票数差距击败Laughlin，成功赢得初选。保罗还让棒球选手诺兰·莱恩担任他的罗恩誉竞选阵营主席。由于保罗一直定居在杰克逊湖，选区重划将保罗分配到临海的第14选区，而不是他之前代表的第22选区。在当年秋季的选举中，保罗的民主党对手—律师Charles Lefty Morris对保罗展开大量的攻击，包括了攻击他支持废除联邦药品法以让各州自行决定的立场，尽管如此，保罗还是以些微的票数差距获胜。
德州共和党党部的高层在1998年又试图要阻挠保罗，但保罗再一次赢得了初选和正式选举。党部高层于是同意与他达成协议：保罗在国会里会和共和党团一同投票、并且维持共和党党籍，以交换他在国会里的各种委员会职位。保罗在2000年和2002年都成功当选连任，并且在2004年无人竞争的情况下当选。2006年的选举中他则以20%的票数差距击败民主党候选人，获得第9届的众议员任期。 Texas Monthly将保罗称为“完全奉守原则而且绝不让步”的人，包括了他从来不向政治行动委员会（PAC）收取补助、从来不向国会里的游说份子低头、始终以他“深刻抱持的原则”投票表决议案、并且从不接受“秘密协议”的手段。他们还写道：“‘诚实的政客’这一词在现在看起来似乎互相矛盾，然而保罗真的是从来没有投票违背任何他的明确原则…这一词真的能够形容保罗。”除了从来没有接受国会的议员退休金以外，保罗的国会办公室每年都会将未用完的经费缴回政府，在2000年这个金额到达$50,000元。不过，联邦选举委员会的纪录显示保罗的确有从PAC收取一部分的资金，虽然这个金额远远少于他在国会的其他同僚。
在一个名为“清洁华盛顿”的团体所列出的特别名单中，保罗是众议院数百名议员中最少向PAC收取资金的第七名，同时也是国会里最少接受来自游说团体的议员之一，除此之外在收受的小额捐款所构成的资金比例排名上保罗是第四名，象征了大多数保罗的捐款都是来自私人的捐助。在2008年的共和党总统候选人之中，保罗所收受的PAC补助是所有人里最少的。
在国会里绰号“不先生”的保罗有时对其他共和党同僚而言也是相当难缠的，因为他并不会顺从党内的压力投票支持那些被他视为浪费纳税人资金的法案，又或者是那些被他视为违反了宪法的案子。曾经有一次共和党的众议院发言人纽特·金里奇发言告诫所有成员都必须和党团一致投票，除了保罗例外。另外一名以坚持财政保守主义闻名的共和党众议员Jeff Flake也在2006年说：“每当我是党团中唯一要投否决票的人时，我通常会想到他（保罗）也会走下来。”保罗也想起在一次432-3的悬殊表决上，他出自原则的理由反对了那个法案，并且集合了仅有的两名支持他的同僚，在众人瞩目下一同投下反对票。 即使是已在国会任职的年间，保罗也一直在得克萨斯州的布拉佐里亚郡担任妇产科医生，接生了许多在他选区内的婴儿。他是众议院里少数（共8人，包括牙医）原职业为医生的议员，更罕见的是他在议员任内仍继续行医。有记者还曾报道在保罗的选区里，碰到自称是由保罗接生的年轻人可不是什么罕见的事。
保罗也会反对一些通常不会被来自乡村或海岸选区的国会议员所反对的法案。保罗的选区是一个濒临墨西哥湾的海岸地带，也包括了休士顿市的一部分郊区。即使如此，保罗仍然反对联邦政府补助的洪灾保险计划，因为那会让那些住在远离洪灾可能地区的人掏腰包补助接近洪灾地区的人，同时也使住在洪灾地区的人不能自行挑选他们的保险计划。即使是位于一个“绝大多数属乡村地区”的选区，保罗仍然反对政府对于农业的补助，因为他认为这种补助最终只会流入大公司的口袋，而不是小农场主们。尽管这样的农业补助法案在国会里受到大量支持，保罗在这方面的“不合群个性”以及他对于减低税赋的推动一直使他受到第14选区选民的信赖。
或许会让一些政客难以想像的是竟然有议员敢投票反对将“猪肉”带回他们自己的选区，原因在保罗花了许多时间经营他的选区，以补偿他“违反了几乎所有你可以想到的政治生存法则”。他一周经常会花上3到4个小时巡游选区、倾听并解决选民的问题，有时候还会带着他那17个孙子女的其中1个作伴。他也频繁参加学校的毕业典礼、各种仪式、或者是童子军的典礼活动。由于选区辽阔，保罗经常在一天内游遍超过300英哩拜访各村镇并解决选民的问题。他在解决第14选区选民的老兵议题上特别有效，例如替那些错过授勋的老兵们争取颁布战争勋章，他也会替那些老兵们主持授勋典礼。保罗有时也会透过一些较不知名的药品公司，协助年长的选民取得免费或低价的处方用药，保罗选区的员工也会定期寄发生日卡片给选民，以及在选民逝世时寄发悼函。 保罗在国会起草了许多的法案，但之中的大多数（比如其中一项要废除所得税的提案）连在他所属的委员会都没有通过。不过他也起草了一些成功通过的法案，例如阻止城市和住房发展部（HUD）以征用权为由企图没收纽约市一座教堂的土地，还有将德州的Texana湖从原本的联邦政府水坝计划转给德州政府管辖。
在国会里保罗是金融事务委员会（Committee on Financial Services）、国际关系委员会、以及联合经济委员会的成员。他是金融事务委员会旗下的监督调查小组委员会的副主席，同时也是国内货币政策小组委员会的成员。在国际关系委员会里，他是西半球、亚洲和太平洋小组委员会的成员。
