Question

NCBI中的BLAST功能可以查多个基因之间的比对吗？

比如我想查金黄色葡萄球菌NUC基因与其他葡萄球菌NUC基因之间的比对
找出一个特异性好的区段 请问下BLAST可以做到吗？
该怎么做高手指点下

Answer 1

不能，要用多序列比较程序，如clustalw.

Answer 2

可以两个。
多个的话就用clustalw

下列网站提供在线ClustalW服务:

http://align.genome.jp/ (推荐)

http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw/

http://www.ch.embnet.org/software/ClustalW.html

http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_clustalw.html

http://clustalw.ddbj.nig.ac.jp/top-e.html

文章来源：柳城博客(http://www.liucheng.name/)
详细出处参考: http://www.liucheng.name/?p=387