用megalign构的建进化树怎么导出
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需要学习DOS命令，而直接使用FASTA格式的序列即可。 或者使用Tree-puzzle，构建ML树，只有适用于64位的版本，速度也较快。 BioEdit集成了一些PHYLIP的程序。 PHYML的不足之处是没有win32的版本构建ML树可以使用PHYML，简单的模型试起，从参数少。 ML的模型选择是看构出的树的likelihood值，不过该程序是命令行格式的，用来构建进化树，速度最快，到likelihood值最大为止，并且该程序做蛋白质序列的进化树效果比较好，不需要事先的多序列比对。 这里作者推荐的工具是BioEdit，因此不推荐使用。 而PAML则并不适合构建进化树。 值得注意的是。 ML也可以使用 PAUP或者PHYLIP来构建。 Tree- puzzle是另外一个不错的选择
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景联文科技
2024-06-11 广告
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