Question

cds是什么意思？

Answer 1

使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。

搜索结果中有四种类型的匹配：特定匹配（specific hits），非特定匹配(non-specific hits)，这些匹配所属的超家族(superfamily)，以及多结构域(multi-domains)。保守特征/位点的氨基酸用小三角形标识，这些位点可能为催化位点或者结合位点等。

如果CD-Search发现特定匹配，则查询序列与命中的保守结构域之间的关联具有高置信度，进推断查询序列的功能也是高可信的。其他类型的匹配也可以揭示查询蛋白的假定功能，其可信度由E值来评价。

扩展资料

特征

保守结构域是指在生物进化或者一个蛋白家族中具有不变或相同的结构域。保守结构域具有重要的功能，不能被改变，是基因的核心。

结构域是介于二级和三级结构之间的一种结构层次，是蛋白质三级结构的基本结构单位。所谓结构域是指蛋白质中由不同二级结构和超二级结构组合而成的独立的稳定结构区域。结构域也是蛋白质功能单元。在多结构域蛋白质中，不同的结构域常常与不同的功能相联系。