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首先要看你的条带是否清晰,虽然亮度不够但是清晰度应该高,没有拖尾没有非特异条带和引物二聚体,如果以上都没有,仅仅是目标条带不够亮的话,我觉得
你可以将25微升体积同比放大至50微升反应体系,相应的制胶的时候插孔槽用大梳子而不是小的那种。还有很重要的就是你的核酸染料是什么?我用过几种核酸染料感觉还是EB亮度最好,虽然毒性大了点。
如果条带不够亮,还有拖尾、非特异条带、引物二聚体等问题,那就是你反应体系中需要优化。1、出现非特异扩增可能是你的引物设计上特异性差或者引物浓度过高,Mg浓度或酶含量过高(适当改变Mg浓度从1mM到3mM,间隔0.5mM进行梯度试验,或者酶含量改变按0.5U为间隔梯度试验。)2、如果出现拖尾,,要考虑引物特异性和模板纯度,另外循环数、退火温度以及Mg含量过高、dNTP过多等也可能造成拖尾。
你可以将25微升体积同比放大至50微升反应体系,相应的制胶的时候插孔槽用大梳子而不是小的那种。还有很重要的就是你的核酸染料是什么?我用过几种核酸染料感觉还是EB亮度最好,虽然毒性大了点。
如果条带不够亮,还有拖尾、非特异条带、引物二聚体等问题,那就是你反应体系中需要优化。1、出现非特异扩增可能是你的引物设计上特异性差或者引物浓度过高,Mg浓度或酶含量过高(适当改变Mg浓度从1mM到3mM,间隔0.5mM进行梯度试验,或者酶含量改变按0.5U为间隔梯度试验。)2、如果出现拖尾,,要考虑引物特异性和模板纯度,另外循环数、退火温度以及Mg含量过高、dNTP过多等也可能造成拖尾。
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可以适当降低Tm温度
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