Question

谁来说说Illumina 454 ABI 测序的区别

Answer 1

首先从原理上说，Illumina测序芯片是桥式扩增，形成“簇”，终止子法，双向测序；454是磁珠法扩增，利用聚合反应副产物PPi后续反应，得到荧光；ABI的SOLiD系统同样是磁珠法扩增，但利用的是连接反应（具体方法略显复杂）。
其次从性能上说，Illumina测序仪的通量极大，目前的HiSeq X已经达到1.6-1.8T；454则是读长最长（这三款）；ABI因为其连接反应测序的特点，其精度应该是最高的。
最后扒一扒他们的短儿，Illumina价格昂贵，尤其后期的极高通量的测序仪不是一般实验室能承受的。同时他们的仪器或许都有人看管，指定该类仪器只能进行某种生物样本的测序，当然其实性价比依然在；454的缺点，只在这三者中比的话，就是其同聚物准确度偏低；对于SOLiD，就是读长特别短，同时因为SOLiD的测序原理，测序系统都相对复杂，因此SOLiD系统不好升级，到了目前似乎已经很少听说SOLiD系统了。