DNA测序方法有哪些
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第1 代测序技术——荧光标记的Sanger 法
第一代就不说了。
第2 代测序技术——循环阵列合成测序法
述第2 代测序技术中, 序列都是在荧光
或者化学发光物质的协助下, 通过读取DNA 聚合酶
或DNA 连接酶将碱基连接到DNA 链上过程中释放
出的光学信号而间接确定的. 除了需要昂贵的光学
监测系统, 还要记录、存储并分析大量的光学图像.
这都使仪器的复杂性和成本增加. 依赖生物化学反
应读取碱基序列更增加了试剂、耗材的使用, 在目前
测序成本中比例相当大. 直接读取序列信息, 不使用
化学试剂, 对于进一步降低测序成本是非常可取的.
在一个正在发生突破瓶颈巨变的领域内, 很难准确
预测未来将发生什么.
第3 代测序技术——直接测序
将基因组DNA 随机切割成大约100 kb 左右的片段,
制成单链并与六寡聚核苷酸探针杂交. 然后驱动结
合了探针的基因组文库片段通过可寻址的纳米孔阵
列. 通过每个孔的离子电流均可独立测量. 追踪电流
的变化确定探针杂交在每个基因组片段上的精确位
置. 利用基因组片段上杂交探针的重叠区域将基因
组片段文库排列起来, 建立一组完整的基因组探针
图. 利用计算机算法, 获得完整的基因组序列.
第一代就不说了。
第2 代测序技术——循环阵列合成测序法
述第2 代测序技术中, 序列都是在荧光
或者化学发光物质的协助下, 通过读取DNA 聚合酶
或DNA 连接酶将碱基连接到DNA 链上过程中释放
出的光学信号而间接确定的. 除了需要昂贵的光学
监测系统, 还要记录、存储并分析大量的光学图像.
这都使仪器的复杂性和成本增加. 依赖生物化学反
应读取碱基序列更增加了试剂、耗材的使用, 在目前
测序成本中比例相当大. 直接读取序列信息, 不使用
化学试剂, 对于进一步降低测序成本是非常可取的.
在一个正在发生突破瓶颈巨变的领域内, 很难准确
预测未来将发生什么.
第3 代测序技术——直接测序
将基因组DNA 随机切割成大约100 kb 左右的片段,
制成单链并与六寡聚核苷酸探针杂交. 然后驱动结
合了探针的基因组文库片段通过可寻址的纳米孔阵
列. 通过每个孔的离子电流均可独立测量. 追踪电流
的变化确定探针杂交在每个基因组片段上的精确位
置. 利用基因组片段上杂交探针的重叠区域将基因
组片段文库排列起来, 建立一组完整的基因组探针
图. 利用计算机算法, 获得完整的基因组序列.
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