实时荧光定量PCR的结果该怎样分析?

为什么最好不用SyberGreen?... 为什么最好不用Syber Green? 展开
百度网友a5592cc
高粉答主

2019-07-28 · 繁杂信息太多,你要学会辨别
知道答主
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1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;

2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;

3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;

4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;

5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价值了,平时我们实验室用BIODAI-PCR荧光定量法测得的扩增曲线的起跳值基本在30左右。

扩展资料:

PVR的循环参数:

1、预变性;

模板DNA完全变性与PCR酶的完全激活对PCR能否成功至关重要,加热时间参考试剂说明书。

2、变性步骤;

循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。

3、引物退火;

退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。退火温度对PCR的特异性有较大影响。

4、引物延伸;

引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。

5、循环数;

大多数PCR含25-35循环,过多易产生非特异扩增。

6、最后延伸;

在最后一个循环后,反应在72℃维持10-30分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。

参考资料来源:百度百科—实时荧光定量PCR

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2021-06-18 · TA获得超过77.1万个赞
知道小有建树答主
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如果有标准曲线,按照标准曲线计算。

一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。

如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就可以了。如你还做了标曲,就用制图中的散点图看R2值。其实这些功能做定量PCR的时候电脑程序应该会自动分析才对,具体情况具体分析。

技术原理

将标记有荧光素的Taqman探针与模板DNA混合后,完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,与模板DNA互补配对的Taqman探针被切断,荧光素游离于反应体系中,在特定光激发下发出荧光,随着循环次数的增加,被扩增的目的基因片段呈指数规律增长,通过实时检测与之对应的随扩增而变化荧光信号强度,求得Ct值,同时利用数个已知模板浓度的标准品作对照,即可得出待测标本目的基因的拷贝数。

以上内容参考:百度百科-实时荧光定量PCR

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ylgtwcat
推荐于2017-11-23 · TA获得超过2万个赞
知道大有可为答主
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如果有标准曲线,按照标准曲线计算。
一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下:
对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。
首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是对照组的2倍。
基因A: delta CT=20-18=2。2的2次方是4。也就是说基因A的量在实验组是对照组的4倍。但是由于加样量是2倍,所以4处以2=2,最后的相对量是2倍。

几点注意:
1。必须确定扩增的特异性
2。 只有相同目标的CT值才能相减(扩增效率有可能不同)
3。 2的某次方只是理论值,实际扩增效率低于2。
4。 最好不用Syber Green
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2018-06-27 · 专注各类elisa试剂盒、血清抗体
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用2-△△ ct法算的话,应如何算? 假设检测A基因,CT分别为(这里记住CT越大,表明相对含量越低) 普通组/Test1:28 实验组1/Test2:29 实验组2/Test3:30 这时候要设对照了,假设Test1为对照组(普通组),当然是以普通组为对照 那么,相对含量为。
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jinrongyu613
2010-12-27 · TA获得超过2.2万个赞
知道大有可为答主
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看CT值、起始拷贝数、标准偏差等

如果是SYBR做的话,再看下溶解曲线
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