Question

列举哪些公司做芯片数据的生物信息学分析比较专业

Answer 1

这家公司我刚做过一次甲基化芯片数据分析。做的信号通路、基因功能（gene ontology）富集分析还可以，能分析出最重要的10个信号转导途径和最重要的10个基因功能，信号通路中的基因出现频次（counts）变化柱图和GO功能的基因出现频次柱图，此外还有pathway富集分析图。
2. 博奥公司
这家公司我也做过一次表达谱，他们能做的东西很全，也做pathway和GO，只是没有那么深入，同时就给一些网站上的现成图谱， 没有pathway富集分析的图。他们的前期数据处理还行，大公司服务态度有待改善。
3. 康成这家公司听说人员流动比较大，基本不做深入的生物信息学分析，只做最简单的手动查找靶点和信号通路。其芯片结果都不是做的很好。
4. 伯克利公司
这家公司生物信息学可做出一个含有大量信号通路和GO的结果来，但结果还需要自己再归纳。我之前的一个illumina 表达芯片在他们那做，实验倒是挺迅速。分析不是他们的强项。
此外，很多基因芯片公司说会包含芯片数据分析，其实很大一部分只是做个组间差异基因，手动帮你找几个细胞信号转导通路和GO，没有归纳的，这样的分析其实是没有做后续生物信息学分析的。抛砖引玉，希望大家补充，以方便大家今后做芯片的数据分析

Answer 2

有个公众号，叫科研猫，他们的团队是六、七个博士组建的，我们实验室托管给他们的，感觉挺靠谱的，不是那种坑钱的水公司，可以试试