通关后，大木博士会看你抓的精灵种类，如果种类达到60只以上的话，会给你去1，2，3号岛的船票。如果不足60种的话，也没关系。只要抓住60种精灵，就回研究所，和大木博士对话，也能得到船票。
图鉴收集到60个以后，去找博士，就可以开启新的剧情了。
到库吉市码头坐船去1岛，首先再去找精灵中心大机器下的那个人吧，得知需要宝石。再去灯火山一次，入口往右走，2个火箭队员在讨论什么，听到1个暗号，在第2个暗号说出来前，2个人沉默了，冲上去K他们。
进洞找红宝石，拿到红宝石后回到精灵中心那个人那里，一段废话后，得到七子岛的船票，去6岛，往下走有一个洞穴是封住的，用居合斩把门打开，到最底层得到蓝宝石，交给1岛精灵中心的男子。
完事了去4岛逛逛先，看到对手，奇迹啊，他居然没有找我虐他，4号岛有一间屋子是冰天王的家，家里没人，去右边山洞救出冰天王。打完后看到火箭队说了5岛仓库，好了，目的明确，去5岛。
来到岛5，纵观岛5城镇地毯式搜索，从左往右，从上到下，先去左边吧(水之迷路)，一个小岛，一个挑战者，还有一个老爷爷(拿蛋)。
下一个目的地是高石神秘地，就是从水之迷路往上走，这里有很多有画画狗的训练家，有个洞穴,进去看看。
不归洞走法：
1、右下(得到气物:敌人命中下降一阶,果然翁带着生蛋可以生出小果然)
2、右上下上(得到潮物:水系威力上升为原来的1.05倍,母的马利露和马利露利带着生蛋可以生出露莉莉)
3、右上下下右右(得到精神草:濒死全恢复)
4、右上下下右左下左(得到奇异甜食:升一级)
5、右上下下右左下右上(遇到阿吉木,与之交战:两个49猫老大,注意,打完后离开那里再去一次可以得到西库头巾，普通招威力*1.1)
扩展资料：
口袋妖怪四大天王的剧情：
4.5版本的话是主角先去橙华森林里面的森之洋馆，进右上方的楼梯来到2层，在里面会看到小光，发现小光的意识被控制了，与小光对战胜利后回到一层，走左上方的楼梯，在里面可以获得月食之羽。当上冠军之后就需要让主角梦醒了。
以下是让主角梦醒的过程：
先去水静市上方的魅影摩天楼找米可利，然后去秘密基地里和小智小茂、希罗娜、阿迪克和艾莉丝对话。<br/><br/> 3.对战完之后会有一段剧情，剧情结束主角会梦醒。
事件： 进入橙华之森的 ，上楼遇到被控制的 ，击败后底楼左侧的楼梯开启，上楼后取得月食之羽并与 对战，完成后前往水静市NPC房间内睡觉进入噩梦， 托付主角平定时空两神的战斗，为测试主角实力展开对战。
事件： 通关后水静市旅馆二楼女子处得到三日月之羽后前往古辰镇某NPC房间里睡觉进入新月岛，捕获。
4号岛：在4号岛一下船就会遇见对手小茂，但说了几句就跑了……值得注意的是，在这个小岛可以养精灵（如图）^_^然后到商店旁边的屋子和里面的人对话，再用冲浪过右面的一个小湖，来到一个冰洞。注意，洞内有些地方需要踩冰，踩两次就会掉到下一层。另外还有滑冰，要利用冰块上的石头转换方向。洞里可以拿到秘传机器07（登瀑布），有个地方要使用登瀑布进去，之后可以遇见四天王之一—冰天王，旁边还有火箭队的人，与其谈话后会发生战斗，赢后会告诉你口令。得到冰天王的感谢后回到坐船那里，出发去5号岛。
5号岛：到达5号岛之后到左上方那里使用冲浪，下水后往左走，登陆之后和如图这个阿伯对话，他会给你一颗蛋（孵化出No.175波克比）。继续前进会到达一个小岛，上面有山洞，洞里边墙四面有洞，是个迷宫，迷宫可以拿5样东西!走法如下（每次都要回到门口才行）：
第1个道具：右-下
第2个道具：右-上-下-上
第3个道具：右-上-下-下-右-右
第4个道具：右-上-下-下-右-左-下-左
第5个道具：右-上-下-下-右-左-下-右-上
走到第5个时会遇到一个女孩，然后把你带回家，发生谈话。之后来到如图地方，和这个人说话，别忘记拿走下面的道具。然后回到岛上坐船去6号岛。
6号岛：到了6号岛，进入PC，就看见小茂。和岛上的人谈话得知，在小岛南面有一扇门无法打开，于是就来到门前。调查那扇门，会出现象形文字（如图），经过研究，知道可以用斩树使门打开。进门后，在最深处找到一块蓝宝石，这时候火箭队一研究员冲过来，把它抢走了……
为了追踪蓝宝石，于是返回5号岛。这时候就可以进入火箭队的研究所（如图），打败研究员后就可以夺回蓝宝石。过后带着蓝宝石回到1号岛的PC屋，将之交给博士。博士就会把通讯机器修理好，现在就可以和宝石版以及NGC的竞技场通讯了……剧情进行到这里，就可以进入超梦山洞了，不过先别着急，还是先坐船到7号岛。
7号岛：到达之后往上走，用冲浪，再往上走，上岸之后来到战斗塔。打过4层之后到顶和这个人对话，中途可以回到1层加血。南面的遗迹里可以捉到No.201安侬。
最后回到华蓝市，在左边山洞口挡路的人已经让开了，进入最深处捕捉超梦吧，有Lv70哦^_^
要到8、9号岛，一定需要神秘船票。或者输入金手指代码02031CF0:3a02，9号岛的；02031CF0:0002，8号岛的。两条金手指分别输入，切记，到达后一定要关闭金手指！
8号岛：这个小岛上有个山洞，沿着山洞的路进去，直到看到一分岔口。往左走，上楼梯，就可以看到一只凤凰（Lv70）；往右走，下楼梯，就可以看到一只洛奇亚（Lv70）。
9号岛：这个小岛除了一个谜题之外就没有任何东西了。你需要做的就是调查那个三角形样的东西，直到它变成红色，这个过程需要最短路程完成，否则就要重新开始。只要你走过去，碰最靠近你的那一边，就可以很容易地完成。当它变成红色的时候，小岛就会摇晃，No.386就会出现，收复它吧^_^
1.冒险还没结束，你只要收集到60种小精灵，就可以找大木博士把精灵图鉴升级成386版，然后在
和大木博士对话一次，接着到挑战四大天王的地方，但进不去，说有个天王失踪了，在到捉火焰
鸟的地方，在入口处会发现两个火箭队的队员，战胜他们后进入山洞，里面回有一些写有盲文文
字的石碑，具体意思是就是曰语中的五十音表，从左往右三排的顺序，大家可以对照实际曰文。
在里面拿到一块红宝石后退出洞里，拿给新岛1的博士，这下就可以去新岛4、5、6、7了。
先到新岛4，一下船就遇到小冒，这下到老实，没说几句就闪人了。这里有饲养屋子，可以把不
同性别的两只小精灵放进去可以生蛋哦。进入洞里，在里面取得07号秘传机，作用是“攀爬”瀑
布，然后到洞的入口处爬上瀑布，在里面见到一帮火箭队的人，战胜他们后退出洞。新岛6，一
进PC屋就遇见小冒，废话一通后走人。往下走到一洞前，门上写着盲文，使用“砍树”技能旧
能打开门，进入后按照“上、左、右、下的顺序往下掉，看见一块蓝宝石，但被一个从天而降的
研究人员拿走。现在暂时没什么头绪，到处逛逛把，来到新岛7，上面有个战斗塔，很有挑战
性，往下走会进入一个山洞，动下脑子把那些石头全部推到机关上。再往下走有7个古代遗迹，
里面可以捉到各种形态的安农。现在回到新岛5，往下走进入火箭队的分基地，在里面得到被抢
走的蓝宝石。带着宝石到新岛1给博士，现在红蓝两块宝石都有了，启动了机器。接着来到打小
霞那个会馆的镇子，原先堵住洞口的人不见了，进入后经过仔细探索，终于找到了传说中的超
梦，70LV，要捉它比较困难，实在没耐心就用大师球一下搞定吧。现在四大天王那又可以去打
了，隐藏要素继续探索中……
2.通关以后读取存盘，博士将我带到研究所里将妖怪图鉴升级为 386 图鉴（需要妖怪捕获数在 60 只以上）之后来到枯叶市的码头，坐船回到一号小岛，和 PC 屋右边的那个博士谈话之后他把船票和地图升级，然后往北走，来到捉火鸟的山脚下，上了台级往右走，在尽头发现两个火箭队的成员守在一个山洞口，和他们对战后，进入山洞，在最深处找到了一块红宝石，出了山洞，回到一号岛屿的 PC 屋里，将刚才在山洞得到的红宝石交给右边的博士，出了 PC 屋，来到码头，现在以经可以坐船去四号小岛。
来到四号小岛，（冰天王康娜的老家），发现了一个妖怪饲养屋，现在才可以让妖怪生蛋，另外还在一个居民家里得到进入训练员塔的通行证，从四号岛屿上右边的小水塘里游过去，来到了一个冰冻的瀑布里，进入瀑布左边的洞里，在里面找到 07 号特技攀登，攀上那条瀑布了，在山洞里面遇到了冰天王，她正在训斥一群火箭队员，我见到这个欺负火箭队员的好机会当然不会放过了，和冰天王一起轻松搞定了他们，在冰天王的威胁下得到了开门的密码（またまた ダマダマ，以后会用到），之后来到码头，坐船到五号岛，岛右下有火箭队的基地，使用密码后 …… 门还没有开，原来还少另外一段，只好坐船到了六号小岛和岛上的人谈话后，来到小岛最南部的大门前，用砍树特技将大门打开，在最深处找到一块蓝宝石，但没有密码拿不走这时候火箭队的一个研究员突然到来，抢走蓝宝石，顺便得到了另外一段密码（カブトはとぶか，汗 …… 甚么幺样的密码啊），追到五号小岛上的火箭队基地里（基地里有特殊的球，隐藏的），来到五号小岛上右边的火箭队研究所里，拿回蓝石，来到一号岛屿的 PC 屋里，将找到的蓝宝石交给博士，最后可以到七号小岛！小岛路上山洞里的石头分别推入凹坑里，神秘 PM 安侬就会出现在下面的遗迹里
最后就可以回到花田市，在花田市的左边山洞拦住出口的人现在已经离开，终于可以进入山洞捕捉最强的口袋妖怪超梦了（非常好用）
