碱裂解法小量提取质粒，加TE后，为什么不溶解？
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手提的话，加入TE溶解的应该不是质粒，而是残余的变性蛋白质。问题不会出在TE，TE是水溶液，核酸是非常容易溶解的物质。顺便，小量质粒提取的话，纯度很好的质粒沉淀是肉眼不可见的，如果是明显的白色物质，就根本不是质粒而是蛋白质残余。你要确定你提取的有没有问题，你应该做两个实验，1是用分光光度计测A260/A280的比值，你这种情况蛋白质污染应该很多，这个值应该远小于1.8。2是做琼脂糖凝胶电泳。
追问
那么说是，产生的沉淀很多了。原因会出现在什么地方呢？
追答
前面打字的时候失误了，加入TE不溶解的部分是蛋白质。一般容易出这种问题的情况是原始菌量大了，加入溶液3复性后转上清时吸到沉淀了，有机溶剂抽提的时候洗到中间相了。但实际上用碱裂解法提取质粒，或多或少都会有蛋白污染，不过一般蛋白污染是不会影响到下游操作的。如果你对质粒的纯度和浓度要求很高，那么我建议你去买一个质粒提取的试剂盒。
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是不是TE有问题啊！
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