DNA琼脂糖凝胶电泳出现拖尾是什么原因?

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听云者
2015-04-16 · TA获得超过9.1万个赞
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电泳出现拖尾现象,英文成为smear,就是弥散.其原因,主要从以下两个方面考虑:
1、PCR产物自身原因:
往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多,而造成PCR的非特异性产物 过多.
对策:①减少Taq酶的量,或调换另一来源的酶.②减少dNTP的浓度.③适当降低Mg2+浓度.④增加模板量,减少引物的用量 ,减少循环次数,提高退火温度.
2、电泳体系的问题:
(1)电泳缓冲液TAE或者TBE的污染,建议更换缓冲液.(2)上样时样品漂了,建议增加上样缓冲液的用量,以及小心加样.(3)电压太高.(4)适当把你的胶的浓度加大.(根据你的片断大小而定)(5)观察你的marker是否也存在拖尾现象,作为对照.
以前有挺多人问过这个问题了 借用下以往问题的最佳答案
中科雷鸣
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巨蟹白少玲
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原因有以下:
1、 可以考虑是不是样品不纯,目的产物与杂带相差不大,所以要多跑一段时间才有尾巴。参考marker,marker应该不会有。如果有的话说明配胶有问题。
2 、琼脂糖检测DNA一般去1~5微升原液,加2微升溴酚蓝便可,注意上样浓度;
3、可能是原液浓度太大造成的;
4、可能DNA已降解。
5、在提取前对样品进行一定的脱腐处理呀。很简单。有一种TENP buffer,文献中查的到的。
6、 DNA降解避免核酸酶污染。
7、 DNA上样量过多,可以减少凝胶中DNA上样量。
8、 所用电泳条件不合适,可以将电泳时电压不应超过20V/cm,温度<30℃,巨大DNA链,温度应 <15℃,核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力。
9、 DNA样含盐过高,可以在电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐。
10、 有蛋白污染,可以采用电泳前酚抽提去除蛋白。
11、 DNA变性,电泳前勿加热,用20mM NaCl缓冲液稀释DNA
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听云者
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电泳出现拖尾现象,英文成为smear,就是弥散.其原因,主要从以下两个方面考虑:
1、PCR产物自身原因:
往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多,而造成PCR的非特异性产物 过多.
对策:①减少Taq酶的量,或调换另一来源的酶.②减少dNTP的浓度.③适当降低Mg2+浓度.④增加模板量,减少引物的用量 ,减少循环次数,提高退火温度.
2、电泳体系的问题:
(1)电泳缓冲液TAE或者TBE的污染,建议更换缓冲液.(2)上样时样品漂了,建议增加上样缓冲液的用量,以及小心加样.(3)电压太高.(4)适当把你的胶的浓度加大.(根据你的片断大小而定)(5)观察你的marker是否也存在拖尾现象,作为对照.
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