为什么pcr 引物设计出来,下游引物加上酶切位点和保护碱基后,有一个Tm值是负值呀?

还有,好多的Tm值都代表什么呢?引物Tm60多,二级结构的Tm达到40度有关系吗?G值有什么用... 还有,好多的Tm值都代表什么呢?引物Tm60多,二级结构的Tm达到40度有关系吗?G值有什么用 展开
百度网友08763aa3d02
2012-04-24 · 超过15用户采纳过TA的回答
知道答主
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Tm值本来就是人为定的一个预测值,三个Tm值代表的是不同的计算方法,常用的是第三种2*AT+4GC。看退火温度时,酶切位点和保护碱基一般是不考虑在内的,因为pcr扩增时这段序列一般是不跟模板结合的,所以计算时也不考虑,只是PCR条件可能需要一些优化。二级结构40度我不懂是什么,一般看二级结构只是主观的看看,太严重的就不要了。G值不知道指的是什么。
研载生物科技(上海)有限公司_
2023-04-12 广告
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ccisccis
2012-04-23 · 超过10用户采纳过TA的回答
知道答主
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基本上设计引物的时候用primer5看看就差不多了,没有非特异没有自身二级结构,然后TM计算就是AT加2GC加4,加在一起就是TM退火温度……不要有连续5个以上一样的碱基,碱基分布均匀一些……就差不多了
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