Question

新生肽链往往无生物学活性为什么

Answer 1

的结构和功能的研究为基础的生物大分子的分子水平上的第一个的理解。生物大分子的结构与功能，不理解的分子生物学研究。的DNA的双螺旋结构的发现，也没有遗传搬入传递的中心法则，就没有今天的分子生物学。由第一分子上输入复杂的对象，甚至多亚单位，多分子复合物和人体结构的分子结构的。同时，生活的运动在过去是很难研究的分子水平上的深化研究和开发的技术手段逐渐改变困难的热点。蛋白质晶体学研究的生物大分子静态（时间统计）的结构分析开始进入动态的，时间分辨的结构分析和动态分析。 25的第13届国际生物技术物理大会研讨会参与的一半以上的蛋白的结构和功能，和“结构和功能”强调动力学（动力学），动态结构或结构的运动和蛋白质的功能之间的关系，以及作为大分子相互作用的贡献。

蛋白质折叠问题被列为二十一世纪的生物物理学的一个重要的问题“，它是分子生物学中心法则的尚未生物的主要问题。的一级序列的三级结构预测的蛋白质分子，并进一步预测其功能，这是一个非常具有挑战性的任务。早在蛋白质折叠，折叠的过程，在最后澄清的中心法则，在这一领域的新发现，近年来，新生肽的折叠过程是一个根本性的问题对新生肽能自发地折叠传统校正的基本概念。其中，X-射线衍射和各种光谱技术和电子显微镜技术，发挥着极其重要的作用。第13届国际生物物理大会上，诺贝尔经济学奖获得者恩斯特报告中强调的一大优势NMR的研究，可以非常详细的研究的蛋白质分子的动态结构或结构运动蛋白分子功能的动态。电流NMR技术已经能够在秒到皮秒的移动的过程中观察到的时域的蛋白质的蛋白质的结构，其中包括主链和侧链的运动，以及在各种温度和压力下的蛋白质折叠和展开的过程，不只是一个具体结构的蛋白质大分子溶液的结构分析，而是更注意波动和运动的结构，例如，运输小分子，酶和蛋白质通常存在两种构象，未结合的配体结合配体构象结构内波动的前奏构象变化的必要，因此需要光谱，光谱和X-射线结构分析的组合结构涨落平衡构象变化和变化的过程中形成的各种中间状态在另一示例中，为了理解如何被折叠的蛋白质，你必须知道几个折叠的时间尺度基本流程和机制，包括形成二级结构（螺旋和折叠），卷曲，长程相互作用，并展开肽彻底崩溃。多种技术用于研究的第二个过程，如快速核磁共振，快速光??谱技术（荧光，远紫外和近紫外圆二色性）。

一个新生肽折叠
蛋白质折叠在很长一段时间，形成的主导的自我理论研究的新的观点装配（自我组装），因此，当折叠的新生肽的研究，这是很自然的，以促进法律的体李森外进入体内的蛋白质折叠研究，利用该模型的变性蛋白复性作为一个新生肽的折叠新合成的多肽链在细胞内，不需要其他分子的帮助下，没有额外的能量补充，它应该能够自发的折叠而形成它的功能状态。

1988，邹承鲁明确新生的肽段的折叠已开始在合成的早期，而不是??合成后开始折叠的同时，与延长的肽，并不断构象的第一成形结构薯扰档的调整将在折叠后的行动肽后合成，然后合成的结构也会影响先前形成的结构的调整，因此，结构通常形成在肽的延伸过程中，还没有一定是最终的功能性蛋白质的结构，因此，形成的三维结构的同时，协调的动态过程。在上个世纪九十年代一类的伴侣（Molecularchaperone）发现新的生物功能的蛋白质，并在更广泛的意义上辅助蛋白（Accessoryprotein）的帮助蛋白质折叠，建议一般折叠新生的肽的细胞内感，需要帮助，而不是自发进行。

其次，折叠和分子伴侣蛋白的作用

蛋白的三维结构体的共价的肽债券和二硫键的，但也极其复杂的弱二级债券在一起。新生儿侧的侧的折叠过程中合成的肽可被暂时形成在最终成熟的蛋白质中不存在大量的不应该有结构，它们往往是一些疏水性表面，不应该是它们之间的一些错误是可能发生这种相互作用而形成的一个非功能性分子，或者甚至会导致分子的数乱聚集和沉淀。按照自组装的教义折叠的每一步都是正确的，足够的和必要的。事实上，在折叠过程中的竞争以正确的方式和错误的方法，以提高蛋白质的合成效率，竞争机制应有助于正确的方式，伴侣生效通过进化。与之结合的新生肽的识别错误的结构，在折叠过程中，产生一个复用和对象，从而防止过早这些表面之间的相互作用，以防止不正确的非功能性的折叠途径，它们的功能被暂时暴露抑制不可逆的聚合物生产，这将不可避免地推动折叠在正确的方向。（比如从哲学的角度来看，它似乎很容易反驳的自组装的理论，它是普遍性原则之间的矛盾，相反，想象如果蛋白质折叠的每一步都是正确的，足够的，必要的，也不会在没有任何矛盾的前提，完成了复杂的形成最稳定的构象，完成从量变到质变的巨大飞跃，从活性肽链越活跃的功能蛋白，这显然是违背的基本原则，理念，从不同的角度，认为生物进化的过程中，充满了非方向性的变化，这些变种适应环境，但也能适应的环境。“自然选择，自然选择淘汰那些不适合保留那些适应蛋白质折叠与此相似呢？，的蛋白质的一级结构是唯一的肽链折叠和形成的特定的三维结构体的内部因素蛋白质的功能，实际上，每一步形成的活性的蛋白质的多肽链中，电位可能会形成不正确的折叠，和如果没有作为分子伴侣的外部因素或其他帮助蛋白质的多肽链作用，可以永远百折成为积极的蛋。）
的伴侣分子机制

伴侣的作用机制实际上是它是如何确定的目标蛋白质，结合与分离机制。一些分子伴侣具有高度的特异性，如一些内的分子的分子伴侣，的细菌Pseudomonascepacia酯酶它自己的私有的分子伴侣。相隔只有3个核苷酸的基因利马酯酶基因LIPA它被编码的，并且可以被由演化发生基因分裂的过程中引起的。伴侣识别特异性不高，它是如何确定的对象，它可以帮助它吗？我只能说，伴侣识别非天然构象，不能忽视的天然构象。形成疏水性核心，由于自然分子，大部分位于分子的折叠后，可能会暴露在内部的疏水性残基，或在折叠过程中的新生的肽段，暂时形成中的天然构象本应该存在于分子内部的疏水性表面，所以，是最有可能的分子伴侣具有疏水表面的组合，例如硫氰酸酶（硫氰酸酶）的分子的疏水性表面的α-螺旋。然而，只有β-折叠片结构的蛋白质，可用于分子伴侣识别。

识别机制取得更大进展。伴侣Bip的内质网管腔，与一种affinitypanning检查Bip的一个随机的序列的12个肽结合特异性的方法，结果表明，海兰（W / X）的Hy-X-的Hy-X-Hymotif与Bipj结合最强的，HY是色氨酸，亮氨酸，苯丙氨酸，即较大的疏水残基。 ,2-4个疏水残基一般是足够的约束力。另一种常见的说法是所谓的伴侣承认熔融领域的结构（moltenglobule）。另一方面，分子伴侣本身与肽结合位点的结构分析最近也取得了一些进展。例如，PAPD多肽结合在它的β-折叠片的晶体结构。 GroEL的约40KD 153-531的核苷酸结合结构域的域。

伴侣的作用，第二个步骤与目标蛋白形成复合物。的一个非常受欢迎的模型已被观察到，分子伴侣常常形成聚`形式的结构的中空中心，用电子显微镜主体14从组成的圆圈，在圆环形形GroEL的分子和一个层轮甜甜圈七个GroES的不对称分子体的协同作用，以形成一个中空的笼状的结构（cagemodel），推测在中间的腔室与周围环境的原状，可以分离出目标蛋白质的进一步折叠。但是，最近日本实验室发现GroEL的，或什至除去其50KD片段的N-末端的78个氨基酸残基，可以不再被组装成14车身结构的亚基之一，有一个定义的分子伴侣功能。因此，我认为：环伴侣可能不是有效的结合位点，也就是14轮二楼的百吉饼体GroEL的分子的疏水残基或所谓的熔球体结构只有一个或几个部分，每一个部分，而剩余的一识别的一部分，作为检测器，和整个的14体GroEL的分子“包装”的圆圈或笼状结构的多肽链中，上的多肽链运动的的岁差方式链的主链中，一旦发现的暂时暴露在折叠过程中的新生肽链的疏水性结构，或所谓的熔融球体结构错误结构，信号转导中的识别位点的环状二聚体，多聚体的结合位点将绑定到生成配合物，抑制不正确折叠。以上是我个人的猜测是冲突的两个实验现象，并试图做出一些解释。至于为什么假设，该运动在多肽链岁差方式的，我不只是觉得这应该是一个动态的过程，并因此提出了一些傲慢的假想，我觉得可能是能够被检测到有根据的X-射线衍射的外观的分子伴侣GroEL的和GroES笼状结构，以看它是否是一个×B?×?是大足以容纳一段的多肽链，或如何其疏水性的性质的内部和外部，和其它物理和化学性质，或许可以找到支持或驳斥上述假设的证据。

以上是蛋白质分子伴侣谈论。最近出现了一个新的术语，“DNAchaperones DNA分子伴侣蛋白，该分子伴侣与DNA结合，并有助于DNA折叠，在这种复合物中，该DNA分子所包围的蛋白质分子的表面，两者高度有序的，并且是结构为一个一定程度上改变DNA转录，复制和重组DNA和蛋白质的这种互动是非常重要的，如果在核小体DNA的包装是必要的。在溶液中的DNA的结构有相当的刚性，必须克服一个能量势垒可以转化成的蛋白复合物的结构，分子伴侣的作用是帮助DNA分子折叠和扭曲，从而DNA稳定在一个合适的蛋白质结构中的特定的配置，此组合形成的复合物中的协同最终澄清，可逆解离下来，无论是DNA分子伴侣伴侣与相关的基因调控，DNA和蛋白质的相互作用，似乎伴侣确实是密切相关的当前的主要问题的中心法则。

分子伴侣和酶区别

伴侣，以确定酶的协助蛋白质折叠只有两个，蛋白质二硫键异构酶（proteindisulfideisomerase，PDI）;另一个肽的脯氨酸的顺式 - 反式异构酶（peptidylprolylcis transisomerase PPI）。在PDI，例如，它是公知的，在蛋白质分子的二硫键和新生儿的肽的折叠是密切相关的，发挥重要的作用，以保持结构稳定性和功能的蛋白质分子。PDI定位内质网管腔，丰富，和之间的催化蛋白质分子中的巯基和二硫键的交换反应，在相同的时间，它被发现是最突出的多功能蛋白，它是除了脯氨酸4 - 羟化酶的α亚基二硫键异构酶的基本功能和微粒体甘油三酯的小亚基转移蛋白复合物，或糖基化位点的结合蛋白（gkycisylationsitebindingprotein），其中，最显着的是，它具有的结合能力的多肽，肽可以是不同的序列长度和电荷分布，特异性低，主相的主链和肽的作用，但巯基结合有一些偏好。一般认为，根据与分子伴侣PDI和伴侣的定义中的蛋白质两种不同类型的帮助，但中国的上海中国科学院生物物理研究所，最近提出了不同的看法，蛋白质二硫键异构酶分子伴侣功能。

自然形成二硫键的蛋白质分子在这些经常需要在不相邻的肽链中的巯基上，受到了一定程度的肽链的折叠，第一位置可以彼此接近以形成正确的二硫键键的位置。肽链折叠是一个缓慢的过程，蛋白质二硫键异构酶催化蛋白质天然二硫键的形成是一个快速的过程，另一方面，具有低特异性的能力结合起来，用各种不同的肽链中存在高浓度的内质网的蛋白质二硫键异构酶，是一种钙结合蛋白是一种蛋白磷酸化，这些都满足条件的分子伴侣，他们推测，蛋白质二硫键异构酶很可能首先通过它延伸，或结合的肽的部分折叠，以防止折叠途径中的错误，并促进正确的中间生成的，以帮助在肽链折叠是相应的巯基配对，这是正确的二硫键的形成的巯基或二硫键的非均相催化氧化，然后形成的原生的二硫化物。他们认为，该蛋白二硫键异构酶的活性和分子伴侣功能不是相互排斥的，而是密切相关的统一。之间的伴侣，帮助新生肽链的折叠酶，可能不应该，也不能够得出一个绝对的分界线。我想：主酶的特征是催化的生化反应，分子伴侣的新生的肽段错误的构象的主要作用，从而防止在肽链不正确的非功能性的折叠途径促使其反应的正确折叠的方向，它是不能被理解为间接催化业务的肽链的折叠纠正明显的角度来看，抑制不正确的折叠途径是平等的，以加快反应速度的，所以，我非常赞成他们的的观点。最近的试验已经为这一假说提供了很好的证据。PDI明显抑制变性的甘油醛-3 - 磷酸脱氢酶严重聚集在复性股份，从而有效地提高了工作效率，复杂的，具有典型的分子伴侣GroE促进系统甘油醛-3 - 磷酸脱氢酶复杂性的影响是非常相似的。

分子伴侣结构不仅解决了晶体结构的分子伴侣对大肠杆菌的PAPD，帮助鞭毛蛋白折叠的伴侣。是N-端结构域HSP70，ATP结合结构域的晶体结构，电子显微镜已明确指出，GroEL的14-Mer的GroEL的七聚体的四级结构堆叠像两个圆形的中空甜甜圈NMR以及各种溶液构象变化研究中的作用的分子伴侣有效的手段的机制。

6个实际应用

伴侣分子伴侣的研究将加深我们对生活的现象，也将增加我们与自然的能力和他们的斗争自己的生存的能力。分子伴侣发挥了重要的作用，在各级的活动，它的突变和损伤引起的疾病，所以你可以期望使用的分子伴侣的知识来治疗所谓的“分子伴侣疾病。在另一方面，使用的分子伴侣的研究成果，从根本上提高基因工程和蛋白质工程的成功率，并也将大大提高人类生活水平发挥重要的作用。

Answer 2

只有肽链的合成，还没有蛋白的加工和修饰

Answer 3

肽链也就是蛋白是怎么执凳握行功能的呢？（也就是什么样的肽链有活性呢？）
蛋白，有活性的蛋白是肽链折叠成一定空间结构之后或单独或几条肽链形成复合体来执行功能。很多蛋白还要进行修饰，甚至和糖、脂等结合形成复合蛋坦粗宴白来执行功能。

肽链的折叠虽然由氨基酸序列决定，但是其折叠需要一定的环境。新生肽链未完成折叠所以没有活性。

真核生物中新合成的肽链N端一段氨基酸序列被称为引导肽引导肽链去特让银定场所（如内质网）进行折叠加工修饰。

Answer 4

未激活