Question

为什么克隆测序得到的结果比PCR片段得到的序列短呢？用的是通用引物测序！

Answer 1

主要的问题在于引物，引物配对的时候，很有可能不在序列的顶端配对，所以得到的序列自然就会少了。
如有不懂，可以再问
祝你学习进步

追问

克隆用的是T载体，引物是M13引物，都是商品的，所以不存在配对不在序列的顶端这个问题吧，因为配对的地方是在目的片段的两侧啊！

Answer 2

正常情况下应该是更长才对，除非是纯化时切错条带了。克隆测序就是为了获得更全面更长的序列。

追问

是啊，所以觉得很奇怪啊！

Answer 3

　　测序结果里找到引物了吗？一般测序结果，靠近引物的几十个碱基很难测出来。