Question

某种蛋白质由1251个氨基酸组成，其中一段肽链的氨基酸序列是：

某种蛋白质由1251个氨基酸组成，其中一段肽链的氨基酸序列是：-丙氨酸-丝氨酸-甲硫氨酸-亮氨酸-甘氨酸-丝氨酸-。

1. 请推测编码这段肽链的DNA双链的碱基序列。
2.用这种方法推测基因的碱基序列可行吗？这种方法有什么优越性？
3.推测能够代替用测序仪进行的基因测序吗？为什么？

Answer 1

1、首先知道物种，如果测序过，可以通过肽指纹图谱比对或blastP筛选，运气好的话，目标会变小。进而反推DNA键继续列。
2、可行性不大，因为所知序列太短了，很可能得到很多个结果，需要验证。优越性就是完全通过生物信息学比对，快，而且省钱。
3、无法代替基因测序，这样的反推，首先就是建立在基因测序的基础上，如果该物种没有测序，无从谈起。

Answer 2

1.丙氨酸的密码子有4种，丝氨酸的密码子有4种，甲硫氨酸的密码子有1种，亮氨酸的密码子有6种，甘氨酸的密码子有4种，就这2个氨基酸序列，可推测的DNA模板链序列可有4×4×1×6×4×4＝1536种之多。
2.这种方法不可行，因为这样推测的DNA序列中不含有非编码区和内含子序列。所以不能代替测序仪。