神奇宝贝卡的游戏开始
双方先洗牌后把套牌放置在场地上的套牌区，然后从己方套牌里抽7张牌。
如果有基本神奇宝贝卡或化石卡，则将它面朝下置于出战神奇宝贝区，同时如果你愿意可以将其他的基本神奇宝贝卡或化石卡面朝下置于后备区。如果没有基本神奇宝贝卡或化石卡，向对手展示你的手牌，待对手确认确实没有后，将它们洗入套牌中，然后从己方套牌里再抽7张牌，如此往复直到你抽到基本神奇宝贝卡或化石卡为止。当一方抽到了基本神奇宝贝卡或化石卡而另一方没有时，每将手牌洗入套牌中一次，抽到基本神奇宝贝卡的玩家可以选择从己方套牌中再多抽1张牌（不是必须）。
双方将自己的套牌上方6张牌移动至奖品卡区。如果双方手中还有基本神奇宝贝卡或化石卡，此时可以继续放置在后备区。然后猜拳或猜硬币正反面决定双方的回合先后顺序，由胜方开始第一回合。双方将出战神奇宝贝翻开正面，游戏开始。
1、抽1张卡：你回合开始时,先抽一张牌,并将其放到你手上。你手上的牌并没有最多数量的限制。当你开始一场新游戏时,先手的玩家第一回合跳过这一部份。在这个阶段中你只能抽一张牌。接下来,你可以做以下2-7中的任何一件事,任何顺序都可以。你也可以都不作。
2、放一个神奇宝贝到你的后备区：从你手上拿一个基本的神奇宝贝，并将其面朝上放到你的后备区。如果你的出战神奇宝贝被击倒，则立刻由后备区放一个神奇宝贝过去取代，否则你就输了这场游戏。在每个回合你可以放任意数量的基本神奇宝贝，任何时间内后备区的最大上限是五个神奇宝贝。
3、贴一个能量卡到你的一个神奇宝贝上：从你手上拿一个能量卡,并将其放到你场上的一个神奇宝贝下方。你一个回合只能放一个能量卡。
4、进化神奇宝贝
5、使用训练家卡：当你使用一个训练家卡，则照卡上所说的去作，之后将其面朝上放到弃牌堆。你的一个回合内可以使用任意数量的训练家卡。
6、撤退你的出战神奇宝贝：如果你的出战神奇宝贝上面有很多伤害指示物，而且快要被击倒了，你也许想要撤退它改由后备区的神奇宝贝来战斗。为了撤退你的出战神奇宝贝，你需要支付它的撤退费用（在卡的右下方），撤退费用表示上每有一个能量符号，你就必须从它上面弃掉一个能量卡。接下来，将其与你后备区的一个神奇宝贝交换。当它们交换时，保持其原有的的伤害指示物、进化卡、以及能量卡（除了那些原本你必须弃掉的之外）。如果你撤退了，你这回合仍然可以使用新的神奇宝贝攻击。你每回合只能撤退一次。
7、使用特殊能力：有些神奇宝贝具有特别的“Poke-Power”，当它们在场上时可以使用。（请记住，后备神奇宝贝也是在场上的，所以它们也可以使用它们的Poke-Power）。每个Poke-Power都是不同的，所以请仔细阅读该能力是如何作用的。你每回合可以使用任意数量的Poke-Power。
8、用你的出战神奇宝贝攻击：你回合内能做的最后一件事就是攻击。如果你的神奇宝贝不能攻击，或是你不想攻击，则你这回合现在就结束了。你每回合只能攻击一次。
