名词解释什么是模体?
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模体,也叫模序,表示蛋白质中具有特定空间构象和特定功能的结构成分。蛋白质中的模体也可仅由几个氨基酸残基组成,例如纤连蛋白中能与其受体结合的肽段,只是RGD三肽。
一个模序总有其特异的氨基酸序列,发挥特殊的功能,例如“锌指结构”(zincfinger),此模体由一个α-螺旋和两个反平行的β-折叠三个肽段组成,形似手指,具有结合锌离子的功能。模体的特征性空间结构使其特殊功能的结构基础。
扩展资料
分为序列模体(sequencemotif)与结构模体(structuralmotif),结构模体指蛋白质中相邻的二级结构单位组合在一起,形成有规则的在空间上能辨认的二级结构组合体。
结构模体在结构层次上高于二级结构,相当于超二级结构。
1、至少2层二级结构,以疏水R侧链通过疏水相互作用稳定(内侧),亲水R侧链在外表面;
2、β-链倾向于右手扭曲(见β-折叠,如β-桶);
3、β链不能与相邻α-螺旋形成稳定氢键连接
4、常见αα、βαβ、βββ、β曲折等。
注意:所有的超二级结构都是motif,但不是所有的motif都是超二级结构。(如shortlinealmotif)
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