PCR结果呈弥散状是什么原因造成的
我上个星期跑完PCR的产物跑琼脂糖凝胶电泳时,所有样都不出现条带,而是弥散状的,从投拖到尾,而maker却是好的,说明不是电泳的问题,我把所有的酶,buffer,Mg+都...
我上个星期跑完PCR的产物跑琼脂糖凝胶电泳时,所有样都不出现条带,而是弥散状的,从投拖到尾,而maker却是好的,说明不是电泳的问题,我把所有的酶,buffer,Mg+都换了一遍了还是找不到原因,结果照旧,谁能告诉我这可能是什么原因造成的,小女子感激不尽
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退火温度较低导致的非特异性扩增是造成遇到问题的原因。可以通过Touch Down PCR或者梯度PCR摸索最佳退火温度后重新进行PCR。
PCR产物放置过久考虑产物降解;如果是PCR后及时上样,考虑引物特异性较差或者模板不纯(包括降解以及掺有别的DNA序列)
PCR可以被认为是与发生在细胞内的DNA复制过程相似的技术,其结果都是以原来的DNA为模板产生新的互补DNA片段。细胞中DNA的复制是一个非常复杂的过程。参与复制的有多种因素。
扩展资料:
PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即:引物(PCR引物为DNA片段,细胞内DNA复制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。
引物有多种设计方法,由PCR在实验中的目的决定,但基本原则相同。PCR所用的酶主要有两种来源:Taq和Pfu,分别来自两种不同的噬热菌。其中Taq扩增效率高但易发生错配。Pfu扩增效率弱但有纠错功能。所以实际使用时根据需要必须做不同的选择。
参考资料来源:百度百科-聚合酶链式反应
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1 模板浓度太高了,结果模板不能很好地和引物结合而自结合了
2 镁离子浓度高了,可能buffer里含有镁离子,你又加了一遍
3 单纯的退火温度问题也许不会造成全部弥散,适当提高些就好,一般比推荐温度高2-3度就可以
4 也许你看到的根本就不是扩增产物,你的引物不合适
5 最好给出你目标片段的大小或是范围,再说下你的程序,大家好帮你看看
6 做个肯定能扩出来的东西一起电泳,检查下是不是你的药品或设备有问题
哥哥我能想到就这些了
2 镁离子浓度高了,可能buffer里含有镁离子,你又加了一遍
3 单纯的退火温度问题也许不会造成全部弥散,适当提高些就好,一般比推荐温度高2-3度就可以
4 也许你看到的根本就不是扩增产物,你的引物不合适
5 最好给出你目标片段的大小或是范围,再说下你的程序,大家好帮你看看
6 做个肯定能扩出来的东西一起电泳,检查下是不是你的药品或设备有问题
哥哥我能想到就这些了
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退火温度较低导致的非特异性扩增是造成你遇到问题的原因。你可以通过Touch Down PCR或者梯度PCR摸索最佳退火温度后重新进行PCR。
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1.你的引物是不是特异性不高?
2.延伸时间够不够长,一般是1k--1min?
3.退火温度是否过低?
4.电泳的问题应该不大,重新换个模板试一下。
2.延伸时间够不够长,一般是1k--1min?
3.退火温度是否过低?
4.电泳的问题应该不大,重新换个模板试一下。
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跑完PCR后,产物最好是当天电泳。时间长了会降解。镁离子、dNTP等这些都会影响PCR结果的,退火温度也很重要,最好优化一下,找到最适退火温度。
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