Question

引物设计的疑问

我真的不懂，如果给出一段序列，如ggcttaaaagctagctacattcggtagcatca（开头为5'段）设计引物，上游引物到底是从这个基因序列的3'开始倒着写引物的序列还是从基因的5'段开始设计？为什么？我都鄙视自己了怎么也绕不过来。。。

Answer 1

http://image.baidu.com/i?ct=503316480&z=0&tn=baiduimagedetail&word=PCR+%D4%AD%C0%ED&in=14906&cl=2&cm=1&sc=0&lm=-1&pn=38&rn=1&di=2787823580&ln=73

把这个看清楚了。注意，DNA双链的上面那条是5'→3',下面那条是3'→5'。相信你应该能看懂。
看不懂再问吧..

Answer 2

不是从这个基因序列的3'开始倒着写引物的。
两端的引物是不一样的。
你可以利用Primer 5.0 引物设计软件来解决。