正向引物和反向引物有什么区别?
正向引物,反向引物。
引物自身及引物亏磨之间不应存在互补序列。连续互补的碱基应该要少于4 个。引物应使其G值不要太高,G值越大,则双链越稳定。
引物长度和GC 含量要适中。引物长度大概为18~28 bp,但不应大于38 bp,引物过短会影响到扩增的特异性,太长的话其延伸温度将会大于74 ℃,不利Taq 酶的催化反应。若扩增产物为4~5 kb,引物最好不要少于24bp。
扩展资料:
注意事项:
1、引物的长度一般为15-30 bp,常用的是18-27 (22)bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA聚合酶进行反应。
2、碱基要随机分布:引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错误引发(False priming)。降低引物与模板相似性的一种方法是,引物中四种碱基的分布最好是随机的,不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在。
3、3′端不应超过3个连续的G或C,如GGG或CCC,因这样会使引物在GC富集序列区错误引发。
4、引物3’端的末位碱基对Taq酶的销仔斗DNA合成效率有较大的影响。不同的末位碱基在错配位置导致不同的扩增效率,末位碱基为A的戚灶错配效率明显高于其他3个碱基,因此应当避免在引物的3’端使用碱基A。
参考资料来源:百度百科-引物设计
参考资料来源:百度百科-正向引物
参考资料来源:百度百科-反向引物
2024-08-28 广告
正向引物(Forward primer)是一种设计用于与目标DNA序列的一条链上的起吵卖培始位点相匹配的引物。它在PCR反应中的作用是在目标序列的起始位点上引发DNA链的合成,并向下游方向扩增。
反向引物(Reverse primer)则是设计用于与配激目标DNA序列的另一条链上的起始位点相匹配的引物。它在PCR反应中的作用是在目标序列的另一条链上引发DNA链的合成,并向上游方向扩增。
正向引物和反向引物之间的区别在于它们与目标DNA序列的互补配对的位置,以及它们在PCR反应中的扩增方向。正向引物用于扩增目标序列的下游方向,而反向引物用于扩增目标序列的上游方向。