《生化危机》病毒起源是什么？
始祖病毒的发现
当年亨利·特拉维斯的勘探总集《自然历史调查》大部分都被他的长兄购回，自此《自然历史调查》在世间彻底消失。然而亨利的长兄却不知道，他并没有全部将书籍收回。出身贵族的斯宾塞家族一直保存着一整套《自然历史调查》，并将其传承了下去。到20世纪60年代，这本书被斯宾塞家族年轻的族长奥斯维尔·E·斯宾塞（Ozwell E Spencer）发现了。而斯宾塞恰恰认同了亨利的见闻。而当斯宾塞看到了亨利记述的有关迪拜亚部落的传承仪式之后，立刻对其中所记述的“太阳阶梯”花朵产成了浓烈的兴趣。他立刻找到了同为贵族的好友爱德华·阿什福德（Edward Ashford）和爱德华的同学、生物学专家詹姆斯·马库斯博士（Dr James Marcus），将这个故事告诉了他们。身为生物学博士的马库斯提出，可能是这个花朵中的某种物质导致了人的进化，并提出希望前往非洲找到“太阳阶梯”花朵，并对其成分进行分析。斯宾塞同意了马库斯的请求，并带着马库斯和他的学生布兰登（Brandon）来到了西非。
在斯宾塞雇佣的武装雇佣兵的帮助下，斯宾塞和马库斯控制了迪拜亚的圣地花坛，并将“太阳阶梯”花朵进行采摘和分析。不久，马库斯的成分分析有了结果——在“太阳阶梯”花朵所产生的物质当中，确实有病毒样的遗传物质成分，而且所体现的特性是全新的。这个结果令斯宾塞和马库斯大为兴奋。马库斯认为这是解读生命进化密码的一把钥匙，并立刻采摘了部分“太阳阶梯”的花朵回到了欧洲，进行细致的研究。马库斯将这种全新的RNA病毒命名为“始祖病毒”，自此揭开了始祖病毒的研究工作。
第一次瓶颈与突破
回到欧洲的马库斯与爱德华·阿什福德一起着手对始祖病毒和“太阳阶梯”进行研究。但是很快他们便失望了。被带回欧洲的“太阳阶梯”花朵不知为什么失去了相应的特性，无法继续提炼始祖病毒了。而在欧洲新培育的“太阳阶梯”花朵也无法产生“始祖病毒”。不死心的马库斯将土壤和水质换为西非时当地的土壤水分，但是“太阳阶梯”仍然无法产生“始祖病毒”。沮丧的马库斯博士为此与他的学生布兰登爆发了激烈的争吵，爱德华也有些不知所错。而就在此时，斯宾塞却提出了一同建立公司的想法。马库斯、布兰登乃至于爱德华对斯宾塞的这个想法毫无头绪，心绪不佳的他们想都没想就同意了斯宾塞，放任斯宾塞去着手组建公司的全部工作。
就在始祖病毒的研究陷入僵局时，爱德华·阿什福德在采回的太阳阶梯土壤附近找到了一只死去的古代女王蚁。爱德华敏锐的感觉这个女王蚁一直从古代存活至今非常不一般，于是着手进行研究。果然，爱德华从这只蚂蚁还存活的细胞中发现了始祖病毒的痕迹，这证实了马库斯在西非的发现，也为始祖病毒的进一步研究打下了坚实的基础。爱德华·阿什福德因此也成为了始祖病毒系列研究的奠基人而为后世所知。
爱德华取得突破之后，马库斯决定回到西非，重新采集始祖病毒。斯宾塞则决定直接在“太阳阶梯”花坛附近建立研究所，提炼始祖病毒并发往各地。这个研究所由马库斯的学生布兰登负责管理。这个研究所就是安布雷拉公司第一个始祖病毒研究机构——非洲研究中心。
非洲研究中心的建立
在斯宾塞的带领下，马库斯回到了西非，并在斯宾塞的武装雇佣兵的帮助下重新控制了“太阳阶梯”祭坛。马库斯在提炼出始祖病毒的几个样本之后回到了欧洲，而布兰登则负责在这里建立非洲研究中心。迪拜亚人不甘心失去圣地，不断的发动袭击，试图夺回圣地。布兰登不得不分神，一面组织在洞窟中建立研究中心，一面组织对迪拜亚人的镇压，还得负责继续采集始祖病毒样本。繁重的工作让布兰登异常烦躁，而问题还不仅如此。
布兰登急于开辟非洲研究中心，改善研究环境。因此他对工程的要求过快过猛。过快的工程导致了地下水的改道，“太阳阶梯”花坛的花朵因得不到水源而开始枯萎。布兰登大为震惊，要求工程部门尽快想办法。工程部门提出使用水泵抽取地下水建立灌溉系统，但是从设备的到位到灌溉渠道的完成至少需要一年的时间。于是布兰登不得不组织人手通过人力提水桶的手段进行不间断灌溉。不少太阳阶梯的花朵因此而枯萎死去，但中心部分的太阳阶梯得以幸存下来。一年后，水泵及灌溉渠道建设完成，而迪拜亚人由于实力悬殊，只能放弃对圣地的争夺，非洲研究中心得以建立完成，时间为1967年。始祖病毒研究所需要的病毒样本开始源源不断的从非洲研究中心送出。
为了确保非洲研究中心的安全，斯宾塞和马库斯严格控制了信息渠道，受雇于斯宾塞前往非洲研究中心的研究人员身份被严格保密，并且雇员对外通信也受到了严格的限制。应该说，非洲研究中心的保密工作非常成功。直到后来非洲研究中心关闭，都很少有人知道这个地方的存在。
研究
非洲研究中心正在兴建的时候，斯宾塞也开始着手在其他地区建立研究机构。其中最重要的研究机构就是位于法国巴黎的欧洲研究中心和位于美国中部阿克雷山区（Arklay Mountain Area）的阿克雷研究所（Arklay Research Factory）。始祖病毒最早的研究成果就是在这个两个区域诞生的。随着研究的深入，始祖病毒及其变异体开始越来越丰富，而国际生化危机的出现也越来越多样化和不可控化。
始祖病毒研究的成果包括：T病毒、G病毒、T-Veronica病毒、T-Aybss病毒、T-Nemisis寄生虫、Las Plagas-II型寄生虫（马基尼）、Las Plagas-III型寄生虫、Uroboros病毒、C病毒等等。
始祖病毒研究的起始
始祖病毒的研究最早是用于对生物进化的研究之中。阿克雷研究所建立完成之前，在欧洲，爱德华和马库斯分别在昆虫类、两栖类和哺乳类动物身上。实验结果发现，这些生物虽然因为各自DNA不同所造成的变异也不同，但是他们都出现了体型巨大、食欲增长的情况。但是，从生物进化的角度上讲，这样的生物很难称之为进化。马库斯对这样的研究结果根本不满足，于是提出要在人类身上进行病毒实验的建议。
1967年，阿克雷研究所建立完成，马库斯被调任至阿克雷研究所附近的干部培训所担任所长，并兼任阿克雷研究所研究主任一职。出于对阿克雷研究所所有机密的保密考虑，在斯宾塞的授意下，马库斯将两种始祖病毒的初级变异体注射到了阿克雷研究所的设计者——乔治·特列沃（George Travor）的妻子杰西卡（Jessica）和女儿莉莎（Lisa）体内。杰西卡体内的变异体并没有对杰西卡产生什么其他影响，却使杰西卡经常出现意识模糊和记忆不清的情况，这个结果并不为人满意，因此杰西卡被安乐死；而女儿莉莎所注射的始祖β变异体产生出了融合迹象，因此被锁在了实验区域，开始了长达十几年的各种生化实验。
特列沃一家的悲剧是始祖病毒研究走入人类的开始，也为整个始祖病毒的研究打下了邪恶和不人道的注脚。值得一提的是，马库斯推开了人体实验这一恶魔之门后，变得麻木不仁。他利用职务之便，擅自将干部培训所内的学员当做了实验体进行实验，也因此遭到了公司上层的排挤，影响力不断下降。这也为后来马库斯的人生悲剧埋下了伏笔。当然这是后话。
T病毒及其系列变种
马库斯在对莉莎（日后被称为“女性实验体”）的研究当中，意识到始祖病毒研究的最大问题在于稳定性，因此马库斯将病毒的稳定性和增强可塑造性作为其研究工作的重点。在经过长期研究和仔细选择之后，马库斯选择将始祖病毒与水蛭基因相结合。马库斯认为，水蛭对环境的耐受力和适应力都是很强的，因此水蛭基因一定能够强化始祖病毒对环境的适应性，从而提升始祖病毒的稳定能力。
1977年8月，马库斯将始祖病毒与水蛭基因的融合实验取得了相当大的成果，始祖病毒的二次变种研制成功并达到了预期目的。与之前的始祖病毒不同的是，这次的变种将原先漫长的融合过程大大的加快，并且使宿主狂暴化。马库斯因此将这个变种命名为“暴君病毒”（Tyrant Virus），简称“T病毒”。
1978年2月，马库斯将T病毒的研究情况在安布雷拉公司董事会公布。马库斯原本以为会以此次公布病毒变种为契机，重新夺回自己在公司董事会的发言权，结果斯宾塞早有准备，在董事会上将马库斯滥用职权，利用干部培训所的学员进行人体试验的事情进行了通报。结果，董事会作出决议，关闭干部培训所，并停止马库斯在阿克雷研究所的研究主任的职务，改由马库斯培养的学员干部阿尔伯特·威斯克（Albert Wesker）和威廉·布金（William Birkin）续任。斯宾塞原准备将马库斯调离至其他部门，但是马库斯拒绝公司调任，并回到了已经关闭的培训所，继续秘密开展相应研究——也就是“水蛭女王”的相关研究。
虽然马库斯的职权被停止，马库斯被调离，但是有关T病毒的相关研究却在阿克雷研究所继续进行。在威廉·布金的主导下，阿克雷研究所利用T病毒及其变种，研制出了“猎人”系列（Hunter）、海王星（Neptune）、地狱犬（Cerberus）等活体生物兵器（Bio Organic Weapon，简称“B.O.W.”）。而T病毒所研制出的最著名的B.O.W.莫过于暴君系列（Tyrant）了。此外，威廉后来发现的G病毒、南极研究所开发的维罗妮卡病毒（T-Veronica）以及2004年出现的T-深渊病毒以及之后不久出现的T-恐惧病毒都是以T病毒为研究基础的。
马基尼与始祖病毒
《生化危机5》的故事所爆发的2008年，在西非出现的人体变异体马基尼（Majini，西非语中意为“恶魔”）是由一种名为普拉卡（Las Plagas）的寄生虫变体所造成的，而这个变异体是由Tricell联合企业将普拉卡寄生虫与始祖病毒融合的结果。始祖病毒中将普拉卡原本的基因链进行了强化，使这种寄生虫寄生人体的速度变得更快。而其通过口服的方式则使感染更为直接、迅速。这种与始祖病毒融合后的普拉卡寄生虫被称之为普拉卡二型（Las Plagas-II）。除了普拉卡二型之外，Tricell联合企业还研制出了普拉卡III型寄生虫，并将其广泛散布于迪拜亚部落附近。
威斯克与始祖病毒
纵观整个始祖病毒的研究计划，有一个计划一直被斯宾塞隐藏较深，这就是斯宾塞最为隐秘的“W计划”。该计划就是从世界各地寻找有着优秀的儿童，并将其集中培养。这些孩子全部被改姓氏为威斯克，给予了他们教导和灌输后，在安布雷拉的全方位监视下，他们被安置在世界的各个角落的安排好的环境中，待时机成熟，将始祖病毒的变异体注射到他们身上，存活者将成为斯宾塞心目中的“优秀子民”。后来的阿尔伯特·威斯克就是这样获得的超人能力。
但即便如此，在斯宾塞看来，威斯克们所注射的病毒变种仍然不是自己心目中的病毒。而从斯宾塞留下来的日记来看，他所向往的病毒最后是研究出来了。那么这种病毒到底是什么？它究竟有什么样的功效？它和始祖病毒的原本特性究竟相差多远，这还是一个值得研究和思考的问题。
艾莉克丝与始祖病毒
威斯克计划最后的幸存者——艾莉克丝·威斯克在始祖病毒的研究上并没有多少成就，相反，她一直致力于实现“永生”这一目的。为此，她从斯宾塞的手中骗走了大量的实验资金和设备，并最终在某种程度上实现了“永生”，只不过这与始祖病毒的联系并不紧密。
不过，艾莉克丝的表现却能够体现出一些始祖病毒的症候——她时不时的咳嗽，对永生程序的渴望和偏执等等。从这些细节中，我们大致可以推知她和阿尔伯特·威斯克一样，注射了始祖病毒的变异株，但是却没有带给她“超人”一样的体魄，却让她的健康大大受损。这也是她偏执于永生的原因。另外，在她成功“转移”到娜塔莉亚·柯达的意志之内后，娜塔莉亚·柯达多了许多特殊的能力。在坏结局中，娜塔莉亚·柯达则表现出了超出阿尔伯特·威斯克的战斗能力，这或许也来自于始祖病毒的变异株。
维罗妮卡病毒、恐惧病毒、C病毒与始祖病毒
维罗妮卡病毒、恐惧病毒分别出现在《生化危机:代号维罗妮卡》《生化危机启示录2》和《生化危机6》中。维罗妮卡病毒、恐惧病毒是以T病毒为病毒基本所研究而出的病毒，C病毒则是以维罗妮卡病毒和G病毒为病毒样本研制而成的。他们与始祖病毒之间的关系是变异与传承关系。
T病毒
全名为Tyrant Virus
威斯卡(Albert Wesker)与柏金(William
Birkin)和研究所所长马卡斯( James Marcus)ⓐ 将始祖病毒与水蛭基因融合，再从实验的水蛭体内萃取出来的变异体病毒,开发出T病毒。
是一种能使受感染者「加速生物体新陈代谢」的病毒，即产生变异。由於T病毒难以控制，以人类为例，过度增生使之迅速死亡并逐渐腐烂，病毒同时亦以在脑中产生微小电流使尸体继续活动。
所以要杀死被感染者，只能破坏其的头部或脊椎，让电流无法再控制神经。
刚开始的症状与一般感冒无异，但会随著时间加重，例如从发烧到皮肤脱落，一般人感染后死亡时间差异相当大，几分钟到几天内发病而亡都有可能，进而成为僵尸，可经由血液、水等等液体传播，亦有空气传染，只是速度不快。
电影版目前的病毒就是T病毒。
T病毒虽然在进化方面非常不足，但是他惊人的新陈代谢能力，如果能稳定那将会带来超人的体能力，只可惜T病毒研究多年始终无法稳定，因此最后在Umbrella被类入为次级病毒。
而T的另一个惊人效果，就是它可怕的传染力，在短时间内若不是上述那10%的人类几乎都会被他从污染的液体、生物的体液交换而感染，同时它还有前所未见的「跨物种」性的感染力:植物,鲨鱼,猩猩,狗等等。
如前所述，T病毒感染的生物成体都是不稳定且能力相对低下的，只有受精卵被感染后才能成长为健康的变异生物。
绝大多数T系生物兵器都只能从受精卵开始培养，就算是可以直接用活人制造的暴君也需要经过长时间的封闭培养
注释
ⓐ: Marcus博士原本要完成这项新的始祖变异体病毒后，被一直虎视眈眈研究成果的Ozwell E. Spencer(Umbrella创始人)给得知，便知道Marcus博士想独占并利用此病毒来夺取公司内的最高发言权，因此先发制人将他原本安插在Marcus博士身边的2个助手Willaim和Albert Wesker给予暗杀的指令，并夺去其成果，最后Marcus博士就在未发表情况下，被已「失踪」名义对外发表。
始祖病毒是从西非迪拜亚部落遗迹中生长的一种被称为“太阳阶梯”（Sonnentreppe）的花朵中提炼出来的。这种花朵中含有一种RNA形态的病毒物质，可以提升人体的能力（包括体力，行动能力等）并延长人类的寿命。不过与这些功能相辅相生的是这种物质带有剧毒特性，很少有人能够承受这种剧毒特性并最终导致死亡。正因为这种物质的存在，因此“太阳阶梯”一直被当地迪拜亚部落视为“圣物”，并在古代被作为“国王选取”的测试物。
从生物学的角度上讲，始祖病毒的RNA特性能够促进人体DNA的进化，这也是人体能力、寿命增长的原因。但是，病毒中所含的毒素（超抗原毒素）会过度刺激人体的免疫系统，从而导致全身炎症，皮肤和其他外层组织坏死，大量的体液流失以及各种疾病的二次感染，进而出现败血症与严重休克，最终导致死亡。而只有极少数的个体在感染后体内的免疫受体会发生突变来防止病毒中的超抗原毒素刺激这些细胞，从而使他们得以存活。
发现
《自然历史调查》
始祖病毒的发现最早可以追溯到19世纪。当时欧洲正盛行着冒险与勘探，许多有志于探索世界一举成名的年轻人纷纷投入到该领域当中。1800年，欧洲著名富商特拉维斯家族中的小儿子亨利·特拉维斯（Henry Travis）将家族中属于自己的资金全部投入到了冒险领域，并立志成为像大卫·利文斯通一样的勘探家并誉满世界。
受到大卫·利文斯通在非洲勘探成果的影响，亨利·特拉维斯先后五次前往非洲大陆进行冒险和勘探，他的勘探遍足非洲每一个角落。亨利对这些地区的地理、气候、动物、植物、矿产、人口分布和民俗等等进行了细致的考察，并形成了详细的冒险记录。在第五次非洲冒险结束之后，亨利·特拉维斯回到祖国，将自己五年来的冒险记录一一整理，并形成了72册的勘探总集《自然历史调查》。
然而，亨利·特拉维斯五年的心血《自然历史调查》并不为欧洲学术界所认同，特别是里面的民俗，被当地学术界看作是“很好的冒险小说”。亨利遭到了学术界冷遇，从此一蹶不振，不久郁郁而终。而亨利的长兄，也就是特拉维斯贸易公司的董事长出面收回了全部流传在外的《自然历史调查》。于是很多人认为，亨利被学术界排挤和漠视，很有可能是这位长兄在幕后操纵的结果，其目的很可能是为了特拉维斯家族能够独享亨利勘探的全部成果。事情的发展恰如预料一般，亨利·特拉维斯的《自然历史调查》成为了后来特拉维斯贸易公司在非洲起步的重要参考文献，特拉维斯贸易也因为在非洲矿业开采、运输上的成功而壮大成联合企业公司Tricell。
当然，亨利和他的《自然历史调查》对后世的影响远不止这些。亨利在其第五次探索非洲大陆时记录的西非民俗成为后来一切生化危机事件的起源，而这恐怕也出乎了亨利·特拉维斯的预料……
迪拜亚部落的仪式
亨利·特拉维斯在第五次非洲探险中，曾亲身经历了一次当地部落的首领选拔仪式。亨利详细的将仪式的全部过程记录在其笔记当中。亨利记录的这个仪式正是迪拜亚部落的首领选拔仪式。
迪拜亚部落（Ndipaya）是散居在西非地区的当地土著部落，人们知道迪拜亚部落的存在是因为当地部落有成熟的房屋建筑能力和遗产保护技术。然而人们所不知道的，是现在迪拜亚居住地的地下正式古代迪拜亚帝国庞大的遗址。
古代的西非地区是由迪拜亚帝国统治的。帝国的国王有着无限的权威，并且被他的子民奉为“最接近太阳神”的神祗。迪拜亚部落流传着一个神话，就是他们的国王拥有数百年的寿命，并且勇敢无畏，刀枪不入。但是，成为迪拜亚帝国国王是一条十分艰辛的道路。因为迪拜亚帝国的王位传承并不是依靠血缘关系，他们保持着原始部落传统的推举方式。推举出来的领袖必须要通过太阳神的考验才能成为国王。这个考验就是“太阳阶梯”仪式。
在迪拜亚帝国地下核心区域，有一片花坛。花坛上种植着迪拜亚的圣物——“太阳阶梯”花朵。这是一个有着剧毒物质的花朵，只有少数能够被神所认可的人才能在吃下花朵后存活。想要成为国王，吃下花朵是必然的考验。而花朵带给新国王的也将是漫长的寿命和强大的力量。千百年来，迪拜亚帝国就是依靠这种方式来选择自己的首领，并将其视为神所认可的人。而迪拜亚的这种传承仪式一直持续到了19世纪。亨利·特拉维斯也有幸看到了这个仪式，了解到了其背后的神话，并将其完整的记录了下来。
但是，亨利·特拉维斯所记录的这个仪式却是迪拜亚帝国最后的国王传承仪式。其后不久，迪拜亚帝国毫无征兆突然灭亡。没有人知道这个王国为什么会消亡，只知道迪拜亚人放弃了地下的生活，开始移居在地上。而且“太阳阶梯”也被迪拜亚人用机关保护起来，不准外人接近。再过不久，欧洲殖民主义时代掀起，迪拜亚部落不可避免的被卷入到殖民世界的浪潮之中，成为欧洲原始资本积累的受害者。至少外人看来确实如此。
但是，从迪拜亚帝国遗迹中的壁画中，我们可以看到这个帝国的最后时光：迪拜亚的地下世界出现了可怕的怪物，这些怪物有着人的身躯，但却多了许多触手。这些怪物撕咬着当地的居民，破碎的尸体遍地都是。而在迪拜亚的圣地，两个巨人一样的怪物正在太阳阶梯的花坛上扭打……这个壁画或许就是描述了迪拜亚部落灭亡的真正原因，笔者猜测，可能是迪拜亚帝国出现了王位争夺，两个王位继承者让各自的支持者吃下了太阳阶梯，结果造成了可怕的后果（这也许就是有记载以来的第一次生化危机）。
迪拜亚部落的灭亡原因并没有被亨利·特拉维斯所记录，但是亨利记录的依靠花朵来提升人类寿命和能力的记述却在20世纪60年代被人发现了。而这个发现导致了始祖病毒的发现和后来的一切……
